O Setor de Educação Física e Esportes (SEFE) tem como função de normatizar, orientar e disciplinar os estudantes através de atividades práticas, teóricas e esportivas. O objetivo é promover o desenvolvimento integral do estudante, um estilo de vida ativo e saudável, a socialização, o espírito de equipe e a prática de esportes.

Os procedimentos metodológicos são realizados através de aulas expositivas dialogadas, pesquisas e trabalhos, exibição de filmes, estudos dirigidos, aulas práticas participativas inclusivas relacionadas aos temas abordados. Além da educação física escolar, a instituição disponibiliza aula de dança, recreação e modalidades esportivas: futsal, voleibol, natação, judô e ginástica rítmica.

De acordo com a BNCC, a Educação Física está estruturada em seis unidades temáticas: brincadeiras e jogos, ginásticas, danças, lutas e práticas corporais de aventura. Sua visão é de que o movimento humano está sempre inserido no âmbito da cultura e deve ser interpretado de acordo com o contexto social e histórico dos envolvidos. Assim, propõe o desenvolvimento de habilidades e competências importantes para ampliar a consciência dos movimentos corporais, dos recursos para o cuidado de si e dos outros, e, também, para desenvolver a autonomia e a participação mais confiante e autoral na sociedade.